BLASTN 2.2.8 [Jan-05-2004]
Reference:
Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schäffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= AE000123|11093
(11,093 letters)
Database: NAE000123.fasta
1 sequences; 11,093 total letters
Searching.done
Score E
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NAE000123|11093|same 2.199e+04 0.0
>NAE000123|11093|same
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Sbjct: 10441 tgtgtgtctgtcatctctttgaacaaaaaataaggcgggagcatttcccgcctgtggtaa 10500
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Query: 7293 tgtttgaagaat 7304
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Sbjct: 5733 gtattgcaatac 5722
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Query: 8687 agatgatattca 8698
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Query: 1619 gcaaatatttgc 1630
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Sbjct: 1630 gcaaatatttgc 1619
Database: NAE000123.fasta
Posted date: May 26, 2005 3:22 PM
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Number of sequences in database: 1
Lambda K H
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Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Hits to DB: 67
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Number of HSP's better than 10.0 without gapping: 1
Number of HSP's successfully gapped in prelim test: 0
Number of HSP's that attempted gapping in prelim test: 0
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effective search space used: 122744241
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