BLASTN 2.2.8 [Jan-05-2004]
Reference:
Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schäffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= AE000128|10483
(10,483 letters)
Database: NAE000128.fasta
1 sequences; 10,483 total letters
Searching.done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
NAE000128|10483|same 2.078e+04 0.0
>NAE000128|10483|same
Length = 10483
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Identities = 10483/10483 (100%)
Strand = Plus / Plus
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Sbjct: 10201 gatcgcggaacggtttgccgactaattcttctgcattggtataaattcggaccggcgtgg 10260
Query: 10261 cgcgcggcgctttcggttttgcaggctccgctttcggctggggtgcagtgctttgaacgg 10320
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Query: 10321 gttcgacaggggatctgcttaacatggaacagccgcttagcatgagtgctactaaacaga 10380
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Query: 10381 tcggtaaagcacgcatagtatttcctcaatgtatgatcaaaacgtcaatattgaatcagg 10440
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Sbjct: 10381 tcggtaaagcacgcatagtatttcctcaatgtatgatcaaaacgtcaatattgaatcagg 10440
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Strand = Plus / Minus
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Query: 906 cgcgccgtgaat 917
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Query: 2156 attcacggcgcg 2167
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Sbjct: 917 attcacggcgcg 906
Database: NAE000128.fasta
Posted date: May 26, 2005 3:22 PM
Number of letters in database: 10,483
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Lambda K H
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Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
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Number of successful extensions: 36
Number of sequences better than 10.0: 1
Number of HSP's better than 10.0 without gapping: 1
Number of HSP's successfully gapped in prelim test: 0
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effective search space used: 109599961
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