BLASTN 2.2.8 [Jan-05-2004]
Reference:
Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schäffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= AE000247|10702
(10,702 letters)
Database: NAE000247.fasta
1 sequences; 10,702 total letters
Searching.done
Score E
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NAE000247|10702|same 2.122e+04 0.0
>NAE000247|10702|same
Length = 10702
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Strand = Plus / Plus
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Sbjct: 10441 cgtaccgtaatttccaagctgctgagagatgcttatttgttcctgaccacgcttactgta 10500
Query: 10501 gaacagattaaaataatcaataaattgtgtctgctcattggtgtctccggtaggaggctt 10560
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Query: 10561 gacggtgtaaccactcattcgactgtaggcactgtcggataagttataaaaaccttgcgt 10620
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Sbjct: 10561 gacggtgtaaccactcattcgactgtaggcactgtcggataagttataaaaaccttgcgt 10620
Query: 10621 agaatagcgatatcctgcgacctggatattggttccacaacaagtttattgctgcacttg 10680
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Sbjct: 10621 agaatagcgatatcctgcgacctggatattggttccacaacaagtttattgctgcacttg 10680
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Strand = Plus / Minus
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Sbjct: 653 atccgtcagtttg 641
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Sbjct: 4770 ttcttctgctgt 4759
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Query: 4759 acagcagaagaa 4770
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Sbjct: 4751 acagcagaagaa 4740
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Query: 5975 gataatggtgcg 5986
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Sbjct: 2069 gataatggtgcg 2058
Database: NAE000247.fasta
Posted date: May 26, 2005 3:22 PM
Number of letters in database: 10,702
Number of sequences in database: 1
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
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Number of sequences better than 10.0: 1
Number of HSP's better than 10.0 without gapping: 1
Number of HSP's successfully gapped in prelim test: 0
Number of HSP's that attempted gapping in prelim test: 0
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length of database: 10,702
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effective search space used: 114233344
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