BLASTN 2.2.8 [Jan-05-2004]
Reference:
Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schäffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= AE000249|10603
(10,603 letters)
Database: NAE000249.fasta
1 sequences; 10,603 total letters
Searching.done
Score E
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Sbjct: 10261 gaccatcctgcgtgctcagtgacggcgggaatgaagtttcaatcggacgaacaacgacca 10320
Query: 10321 cgccagaattcagatcggtgtgctcattcaggagatcgatttgccagtcaacaaaggcgc 10380
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Sbjct: 10321 cgccagaattcagatcggtgtgctcattcaggagatcgatttgccagtcaacaaaggcgc 10380
Query: 10381 gcaggaagttaccttcaccaaactgaatgatacgttctggatactgtgcaccgggaaaat 10440
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Query: 10441 cgcgacgatttagtgttttcacaatgggttcccttctgattagtcatacaacctgtttga 10500
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Sbjct: 10441 cgcgacgatttagtgttttcacaatgggttcccttctgattagtcatacaacctgtttga 10500
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Sbjct: 10501 attggtacgacaggttagcaaactttaatacgccgaacccctgttttgatcaactcctga 10560
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Strand = Plus / Minus
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Score = 24.3 bits (12), Expect = 5.5
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Query: 9746 gtcgagaaaacc 9757
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Sbjct: 2884 gtcgagaaaacc 2873
Database: NAE000249.fasta
Posted date: May 26, 2005 3:22 PM
Number of letters in database: 10,603
Number of sequences in database: 1
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
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Number of HSP's better than 10.0 without gapping: 1
Number of HSP's successfully gapped in prelim test: 0
Number of HSP's that attempted gapping in prelim test: 0
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length of database: 10,603
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effective search space used: 112126921
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