BLASTN 2.2.8 [Jan-05-2004]
Reference:
Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schäffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= AE000306|10446
(10,446 letters)
Database: NAE000306.fasta
1 sequences; 10,446 total letters
Searching.done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
NAE000306|10446|same 2.071e+04 0.0
>NAE000306|10446|same
Length = 10446
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Identities = 10446/10446 (100%)
Strand = Plus / Plus
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Sbjct: 10321 ggcgcacatcaggcgctattaaacaccctcaaaatttaacgatttctgcggttaaagcgg 10380
Query: 10381 atgaagctcaccttcgtccgctctccccttctcttttctgccttttttagccaggattaa 10440
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Sbjct: 10381 atgaagctcaccttcgtccgctctccccttctcttttctgccttttttagccaggattaa 10440
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Sbjct: 6243 tgaaacgtttca 6232
Score = 24.3 bits (12), Expect = 5.3
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Query: 10080 gttgctggcatt 10091
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Sbjct: 2945 gttgctggcatt 2934
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Query: 8219 tgcgtttttctg 8230
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Sbjct: 434 tgcgtttttctg 423
Database: NAE000306.fasta
Posted date: May 26, 2005 3:22 PM
Number of letters in database: 10,446
Number of sequences in database: 1
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Hits to DB: 103
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Number of successful extensions: 31
Number of sequences better than 10.0: 1
Number of HSP's better than 10.0 without gapping: 1
Number of HSP's successfully gapped in prelim test: 0
Number of HSP's that attempted gapping in prelim test: 0
Number of HSP's gapped (non-prelim): 13
length of query: 10,446
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effective length of database: 10,432
effective search space: 108826624
effective search space used: 108826624
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