BLASTN 2.2.8 [Jan-05-2004]
Reference:
Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schäffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= AE000391|10506
(10,506 letters)
Database: NAE000391.fasta
1 sequences; 10,507 total letters
Searching.done
Score E
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Query: 3171 gcaccagcggga 3182
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Sbjct: 2285 gcaccagcggga 2274
Database: NAE000391.fasta
Posted date: May 26, 2005 3:22 PM
Number of letters in database: 10,507
Number of sequences in database: 1
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Hits to DB: 87
Number of Sequences: 1
Number of extensions: 87
Number of successful extensions: 24
Number of sequences better than 10.0: 1
Number of HSP's better than 10.0 without gapping: 1
Number of HSP's successfully gapped in prelim test: 0
Number of HSP's that attempted gapping in prelim test: 0
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effective search space used: 110092556
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