BLASTN 2.2.8 [Jan-05-2004]
Reference:
Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schäffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= AE000410|10826
(10,826 letters)
Database: NAE000410.fasta
1 sequences; 10,826 total letters
Searching.done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
NAE000410|10826|same 2.146e+04 0.0
>NAE000410|10826|same
Length = 10826
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Strand = Plus / Plus
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Query: 10321 tcagccgcgtctttttccatcttcgcctgagcagaagacttcacgcgagcttcgaatgct 10380
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Query: 10801 tcagactctttttgtttaaattagtt 10826
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Strand = Plus / Minus
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Sbjct: 6687 tacaccggtgta 6676
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Query: 3104 taaatatattta 3115
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Sbjct: 3115 taaatatattta 3104
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Sbjct: 2476 agccagccccag 2465
Database: NAE000410.fasta
Posted date: May 26, 2005 3:22 PM
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Lambda K H
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Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
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Number of HSP's successfully gapped in prelim test: 0
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effective search space used: 116899344
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