Strains

cDNA/BAC/Fosmid

Plasmid for Knock-in Experiments

Information

Medaka Tools

Medaka Strain
in Publications

References
Lectures of
a conference

Related documents

Biological experiments for elementary, junior high and high school students (Japanese)
Medaka experiments that anyone can do (Japanese)
Life of my teacher Tatsuo AIDA (Japanese)

Featured Link

From spawning to hatching of medaka ~nibb×niconico 
A checklist of the parasites of medaka 
medaka SNP(Beta)
Official Endocrine Disruption Website
M-marker 2009
Ensembl Medaka
M-Base
NBRP Medaka Genome Project
MEPD
Genomicus - Synteny browser -
ZFIN
ZIRC
UTGB Medaka
UCSC In-Silico PCR
The Fish Biology Journal of Medaka (Vol.1 - Vol.3)
The Fish Biology Journal of Medaka (Vol.4 - Vol.11)
Introduction to Medaka (NBRP Online Forum 2020)

CLSTF01894     VD

Merge cluster information
Name CLSTF01894
Library ALL 741 cDNA [Download: FASTA]
olea 0 cDNA
oleb 0 cDNA
olec 0 cDNA
olvl 3 cDNA [Download: FASTA]
olvl44d16  olvl49i16  olvl60k14 
olli 738 cDNA [Download: FASTA]
olli10a06  olli10a15  olli10c23  olli10d10  olli10e04  olli10i04  olli10j05  olli10l10  olli10l15  olli10n02  olli11a18  olli11b08  olli11b10  olli11c07  olli11e17  olli11e20  olli11f21  olli11h08  olli11h13  olli11h22  olli11l02  olli11n03  olli11n04  olli11o12  olli11o14  olli12c11  olli12d18  olli12f14  olli12g21  olli12h16  olli12h18  olli12j21  olli12k09  olli12k18  olli12k20  olli12k23  olli12l07  olli12m21  olli13a17  olli13c13  olli13c23  olli13f09  olli13f10  olli13f22  olli13j15  olli13j24  olli13l21  olli13p15  olli14a05  olli14b10  olli14c19  olli14c24  olli14d14  olli14g07  olli14m08  olli14n06  olli14n22  olli14p13  olli15a17  olli15b04  olli15b15  olli15c10  olli15f04  olli15f05  olli15h24  olli15j20  olli15m19  olli15m21  olli16c03  olli16c22  olli16d10  olli16d11  olli16e04  olli16e12  olli16e23  olli16f07  olli16f13  olli16h06  olli16i15  olli16j17  olli16k02  olli16n06  olli17a12  olli17c03  olli17d03  olli17e11  olli17e12  olli17f18  olli17g21  olli17h17  olli17j09  olli17j22  olli17k24  olli17m23  olli17p20  olli18b12  olli18c10  olli18e12  olli18f04  olli18f11  olli18j23  olli18m17  olli18o20  olli18o24  olli19a14  olli19b18  olli19c04  olli19d05  olli19e07  olli19h06  olli19i11  olli19j03  olli19l09  olli1a13  olli1b15  olli1c01  olli1c08  olli1d03  olli1d04  olli1d12  olli1g09  olli1g20  olli1i05  olli1i17  olli1i19  olli1k01  olli1k16  olli1l06  olli1n17  olli1n23  olli1o18  olli20g20  olli20h24  olli20i05  olli20i14  olli20l04  olli20p17  olli21a10  olli21b03  olli21b08  olli21b23  olli21e03  olli21e22  olli21f24  olli21g04  olli21g11  olli21g22  olli21i23  olli21j12  olli21k17  olli21n18  olli21n24  olli22a21  olli22b05  olli22c13  olli22c16  olli22d15  olli22e17  olli22h05  olli22h10  olli22j24  olli22k02  olli22l21  olli22l23  olli23b10  olli23d10  olli23e15  olli23f01  olli23f18  olli23h10  olli23h22  olli23i21  olli23k06  olli23l07  olli23m02  olli23m19  olli23n21  olli23p05  olli23p17  olli23p23  olli24a06  olli24a12  olli24b05  olli24e18  olli24e23  olli24g15  olli24j13  olli24k17  olli24m03  olli24n12  olli24n13  olli24n19  olli24o15  olli25a08  olli25b10  olli25d05  olli25e14  olli25h14  olli25j02  olli25j15  olli25l21  olli25n09  olli26a05  olli26c21  olli26d04  olli26d06  olli26d13  olli26d23  olli26e16  olli26e18  olli26f03  olli26f08  olli26g15  olli26g21  olli26h16  olli26j03  olli26k19  olli26l06  olli26l17  olli27b03  olli27d07  olli27e11  olli27f14  olli27g02  olli27g08  olli27i12  olli27l11  olli27m08  olli27n14  olli27p14  olli28a06  olli28a22  olli28b07  olli28c03  olli28d02  olli28d17  olli28e24  olli28f23  olli28g02  olli28j18  olli28j20  olli28k14  olli28n10  olli28o09  olli28o19  olli29a22  olli29b21  olli29c09  olli29c21  olli29c22  olli29c24  olli29d22  olli29e15  olli29k23  olli29n06  olli29n17  olli29o23  olli2a03  olli2a07  olli2c07  olli2d01  olli2e20  olli2i03  olli2i22  olli2j16  olli2o22  olli30a04  olli30a13  olli30b06  olli30b07  olli30i15  olli30l05  olli30l17  olli30n08  olli30o04  olli30p09  olli31a08  olli31b15  olli31b23  olli31d21  olli31e07  olli31f10  olli31h10  olli31h16  olli31h23  olli31i05  olli31l15  olli31n16  olli31n18  olli31p10  olli31p16  olli32c03  olli32c15  olli32d07  olli32e04  olli32f14  olli32h13  olli32h22  olli32i10  olli32j14  olli32k10  olli33b01  olli33c10  olli33c23  olli33d24  olli33e12  olli33e23  olli33i19  olli33j22  olli33m07  olli33p15  olli34c13  olli34d07  olli34e04  olli34g09  olli34g14  olli34h06  olli34h20  olli34i04  olli34k07  olli34n01  olli34n02  olli34o09  olli34o12  olli35c04  olli35d22  olli35d24  olli35e08  olli35i16  olli35j02  olli35j17  olli35l01  olli35m18  olli36c18  olli36d20  olli36d24  olli36f05  olli36h05  olli36h19  olli36i03  olli36i22  olli36k04  olli36l07  olli36l21  olli36m08  olli36n04  olli36o23  olli37a23  olli37b12  olli37c20  olli37e06  olli37f23  olli37g16  olli37j15  olli37j24  olli37l11  olli37n04  olli37o17  olli38b09  olli38b17  olli38e06  olli38f08  olli38f17  olli38g05  olli38g16  olli38g22  olli38k04  olli38l07  olli38l23  olli38m09  olli38m21  olli38n15  olli38o14  olli39f01  olli39f03  olli39g20  olli39h08  olli39h10  olli39i21  olli39l09  olli39n04  olli3c21  olli3d03  olli3f20  olli3h19  olli3i01  olli3i05  olli3p16  olli40a01  olli40a02  olli40a04  olli40a20  olli40b10  olli40c19  olli40f10  olli40f12  olli40l01  olli40n09  olli40n24  olli41c06  olli41e14  olli41e18  olli41f13  olli41f14  olli41g06  olli41g10  olli41j03  olli41j21  olli41k06  olli41n17  olli41n21  olli41n23  olli41o10  olli41o17  olli41p07  olli41p21  olli42a03  olli42a24  olli42c10  olli42g11  olli42h07  olli42j17  olli42l13  olli42n02  olli42o04  olli42p07  olli43b05  olli43c09  olli43c13  olli43c20  olli43e02  olli43h01  olli43j24  olli43k07  olli43l24  olli43m07  olli43m22  olli43o08  olli44c01  olli44c10  olli44e02  olli44f04  olli44i17  olli44k13  olli44n07  olli44n08  olli44o17  olli44o19  olli45c07  olli45c14  olli45g22  olli45l17  olli45n14  olli45o02  olli45o16  olli45p11  olli45p13  olli46a09  olli46b18  olli46b20  olli46c13  olli46d05  olli46d12  olli46g18  olli46k04  olli46k22  olli46l10  olli46m07  olli46n09  olli46n10  olli46o06  olli46p04  olli46p15  olli46p22  olli47a03  olli47b17  olli47e20  olli47i14  olli47k18  olli47l06  olli47l09  olli47m04  olli47n19  olli47n23  olli47o12  olli47p16  olli48a24  olli48e16  olli48f17  olli48f18  olli48h20  olli48i05  olli48j17  olli48m06  olli48m09  olli48n06  olli48n09  olli48o17  olli48o22  olli49b21  olli49c14  olli49f18  olli49g07  olli49i16  olli49l17  olli4a11  olli4a22  olli4b06  olli4b07  olli4c06  olli4d11  olli4e11  olli4j22  olli4m01  olli4n06  olli4n15  olli4p06  olli50a15  olli50a22  olli50d12  olli50d20  olli50e16  olli50e24  olli50h22  olli50j11  olli50j19  olli50p13  olli50p22  olli51a04  olli51a11  olli51g18  olli51i03  olli51i07  olli51i24  olli51n04  olli51n07  olli51o02  olli51o24  olli51p03  olli52a01  olli52a03  olli52a19  olli52c20  olli52d03  olli52f12  olli52f18  olli52g24  olli52h13  olli52h22  olli52i04  olli52i07  olli52l05  olli52m02  olli52m20  olli52p08  olli53b02  olli53c05  olli53c22  olli53d06  olli53g08  olli53g14  olli53i09  olli53k18  olli53l03  olli53m12  olli53o12  olli53o19  olli53p11  olli54g01  olli54g11  olli54h14  olli54i15  olli54k03  olli54l12  olli54l18  olli54n06  olli54n20  olli54p16  olli55b16  olli55c18  olli55f21  olli55i11  olli55j15  olli55j16  olli55l01  olli55m10  olli55n21  olli55p11  olli56b12  olli56b18  olli56b19  olli56d12  olli56e23  olli56f08  olli56h17  olli56i04  olli56j02  olli56l13  olli56m23  olli56n06  olli56o19  olli56p17  olli57a10  olli57b11  olli57b21  olli57f11  olli57f17  olli57i21  olli57j11  olli57j14  olli57k11  olli57m08  olli57o21  olli57o22  olli57o24  olli57p14  olli58a22  olli58c10  olli58c20  olli58e12  olli58e15  olli58h21  olli58j15  olli58n21  olli58o04  olli58o17  olli58p12  olli58p21  olli59c04  olli59f04  olli59g11  olli59h19  olli59p13  olli5a10  olli5b16  olli5b18  olli5b23  olli5d14  olli5d18  olli5e23  olli5f19  olli5i19  olli5l07  olli5m16  olli5p24  olli60c11  olli60f13  olli60g14  olli60g18  olli60g22  olli60h01  olli60i04  olli60p04  olli60p07  olli61c12  olli61e15  olli61f03  olli61j15  olli61j18  olli61k14  olli61l19  olli61o23  olli61p13  olli62a19  olli62c06  olli62d06  olli62f09  olli62j12  olli62j22  olli62k05  olli62l09  olli62l13  olli62n06  olli62n15  olli62o17  olli62o22  olli63d03  olli63g10  olli63i07  olli63i10  olli63i22  olli63j08  olli63m13  olli64a23  olli64b01  olli64c12  olli64g16  olli64j18  olli64j21  olli64m03  olli64m05  olli64n17  olli64o22  olli64p04  olli65b11  olli65b18  olli65c01  olli65e15  olli65f15  olli65h02  olli65j23  olli65m01  olli65m12  olli65o12  olli6a09  olli6e22  olli6g11  olli6g16  olli6h05  olli6i22  olli6n24  olli7d08  olli7o11  olli7p03  olli8b13  olli8c06  olli8c10  olli8d22  olli8e11  olli8e14  olli8h11  olli8k16  olli8k23  olli8k24  olli8l01  olli8l03  olli8o18  olli8p15  olli9b14  olli9c16  olli9d22  olli9g22  olli9k19  olli9l18  olli9m14  olli9m16  olli9m18  olli9p11 
olbr 0 cDNA
olgi 0 cDNA
olki 0 cDNA
olsp 0 cDNA
olte 0 cDNA
olova 0 cDNA

Before using Assemble Viewer, please ensure that you have the latest version of Java. If you are not using the latest Java version, please download it here. http://java.com/ja/download/


Contig information - 1
Name Contig1
Clone count 1 clones
Length 761
Assemble Result Assemble Viewer
Homology(BLAST)
Top Hit vitellogenin 1 [Oryzias latipes]
Score 754
Evalue 4.16125e-78
Detail
Sequence [Download: FASTA]
>Contig1
GACAACCCCATTCAGCCATGAAAGCGGTTGTGCTTGCCCTGACTCTGGCCCTTGTGGCTGGACAA
CATCCCAACTTTGCTCCGGATTTTTCTGCTGGCAAAACCTATGTGTACAAGTATGAGGCGTCCAT
CATGAGCGGTTTGCCTGATGAGGGTTTGGCAAGAGCTGGACTCAACGTCTCCAGCAAAATCCTCA
TTAGTGCTGTACATGAAAATACATACATGTTGAAGCCTTTAGAACTTATTATCAATGAGTACAAT
GGTATTTGGCCAAAGGATCATCCAGAGCCAGTTGGCAAGCTGACTGCTGCTATGACACCAGAGCT
CAACATTCCCATCAAGTTTGAATACAGCAATGGTGTTGTAGGAAAAGTGTTTGCCCCCGAAGGAG
TCTCAGATTTGGTCCTGAACTTCTACAGAGGTTTCCTTAACATCCTTCAGCTTAACATCAAGAAG
ACCTAGAAGTACTCTGGAGCAAGTACAGAAATATGCCTTCTCACAGATTTTGGCTCTTAGAGGCT
ATTCCCGCCATTGGAACCTCTGCTGCTGTCAGATTCATCAAGGAGAAATTTCAGGCTGAAGACTT
AAGTGTTGCTGAGGCAGTTAGAACCTTGGTTGCAGCTGTTCACATGGTTAAAGCAAATCCTGAAT
CCATCAAGCTCTTTGAGACCCTCACCGAAGACAACAAAATCGATGCCAACCCAGTTCTACGTGAG
ATCGTCTTCCTCGGATACGGCACAATGATTTCCAAATATTGTGAAG

Contig information - 2
Name Contig2
Clone count 1 clones
Length 720
Assemble Result Assemble Viewer
Homology(BLAST)
Top Hit vitellogenin 1 [Oryzias latipes]
Score 799
Evalue 2.36294e-109
Detail
Sequence [Download: FASTA]
>Contig2
GACAACCCCATTCAGCCATGAAAGCGGTTGTGCTTGCCCTGACTCTGGCCCTTGTGGCTGGACAA
CATCCCAACTTTGCTCCGGATTTTTCTGCTGGCAAAACCTATGTGTACAAGTATGAGGCGTCCAT
CATGAGCGGTTTGCCTGATGAGGGTTTGGCAAGAGCTGGACTCAACGTCTCCAGCAAAATCCTCA
TTAGTGCTGTACATGAAAATACATACATGTTGAAGCCTTTAGAACTTATTATCAATGAGTACAAT
GGTATTTGGCCAAAGGATCATCCAGAGCCAGTTGGCAAGCTGACTGCTGCTATGACACCAGAGCT
CAACATTCCCATCAAGTTTGAATACAGCAATGGTGTTGTAGGAAAAGTGTTTGCCCCCGAAGGAG
TCTCAGATTTGGTCCTGAACTTCTACAGAGGTTTCCTTAACATCCTTCAGCTTAACATCAAGAAG
ACACATAACGTCTATGATCTGCAGGAGGTTTGTCTAAACAGCGAAAGACTCTCTTTTATTAAACT
GGAGCAACGACTTTTATTGCTTGAATAATGAATTGTATTCATTAGGCTGGAACTCAAGGTGTCTG
CAAGACCCTCTATTCTGTCAATGAAGATGTAAAGGCTGACCGCATCCTCCTGACTAAAACCAGGG
ACATGAACCACTGTCACGAAAGGATCTCTAGAGAAATTGGGTTGGCATACACTGAGAAATGTGAC
GAGTG

Contig information - 3
Name Contig3
Clone count 274 clones
Length 1442
Assemble Result Assemble Viewer
Homology(BLAST)
Top Hit major vitellogenin isoform 1 [Clupea harengus]
Score 657
Evalue 3.60378e-128
Detail
Sequence [Download: FASTA]
>Contig3
GACACTTTGTCTGTATTACCTAATTTTTTTAGCACAGCACTTGCCTTTAAAAAGGCTGTAGGGCC
ACAACTGATCCTCACAACCCCATTCAGCCATGAAAGCGGTTGTGCTTGCCCTGACTCTGGCCCTT
GTGGCTGGACAACATCCCAACTTTGCTCCGGATTTTTCTGCTGGCAAAACCTATGTGTACAAGTA
TGAGGCGTCCATCATGAGCGGTTTGCCTGATGAGGGTTTGGCAAGAGCTGGACTCAACGTCTCCA
GCAAAATCCTCATTAGTGCTGTACATGAAAATACATACATGTTGAAGCCTTTAGAACTTATTATC
AATGAGTACAATGGTATTTGGCCAAAGGATCATCCAGAGCCAGTTGGCAAGCTGACTGCTGCTAT
GACACCAGAGCTCAACATTCCCATCAAGTTTGAATACAGCAATGGTGTTGTAGGAAAAGTGTTTG
CCCCCGAAGGAGTCTCAGATTTGGTCCTGAACTTCTACAGAGGTTTCCTTAACATCCTTCAGCTT
AACATCAAGAAGACACATAACGTCTATGATCTGCAGGAGGCTGGAACTCAAGGTGTCTGCAAGAC
CCTCTATTCTGTCAATGAAGATGTAAAGGCTGACCGCATCCTCCTGACTAAAACCAGGGACATGA
ACCACTGTCACGAAAGGATCTCTAGAGAAATTGGGTTGGCATACACTGAGAAATGTGACGAGTGC
CAGAAGGAATCCAAAGAATCTGAGAGGTTCTACATCATACAGATACATCTTGAAAGCCAGTTCCC
CAGCGGCATTATGATCCTGGAGGCAGATGTAAATGAGCTAATCCAGTTTTTCACCTGTGTCTGAG
CGTTACGGAGCTGCTCAAACAGAGACCAGACAAACCTTGGTCTTCCTTGAGATTCAGAAATCCCC
TATTGCACCCGTCTCTGCTGAGTATCATCATCGTGGATCTCTCAAGTATGAGTTCTCAAAAGAGT
TTGAGCTCTCACCACTTCAACTTGTCAAAGTTACTGATGAACGCGCCCAGACCGAGGAGCTTCTG
AATCATCTAGTTACCCACAATGCCGAAAAGGTCAATGATCATGCTCCTCTGAAGTATTTGGAATT
GATTCAGTTTTTACGTCTTGCCCGCTATGAAGACCTAGAAGTACTCTGGAGCAAGTACAGAAATA
TGCCTTCTCACAGATTTTGGCTCTTAGAGGCTATTCCCGCCATTGGAACCTCTGCTGCTGTCAGA
TTCATCAAGGAGAAATTTCAGGCTGAAGACTTAAGTGTTGCTGAGGCAGTTAGAACCTTGGTTGC
AGCTGTTCACATGGTTAAAGCAAATCCTGAATCCATCAAGCTCTTTGAGACCCTCACCGAAGACA
ACAAAATCGATGCCAACCCAGTTCTACGTGAGATCGTCTTCCTCGGATACGGCACAATGATTTCC
AAATATTGTGAA
/medaka